是的,只是日语演化过程中的一个巧合。
可愛い最早的形态是かおはゆし,意思是害羞,后来音变为かはゆし,再逐渐演变成かはいい(かわいい)。
至于这里的は为什么读wa,牵涉到一个概念——ハ行転呼,即历史上は行假名在非词首位置辅音弱化为[ɰ](类似于w)的现象, 由此而产生了わ行假名。
最后补充一下は行假名辅音的演化过程: