「德尔塔克戎」变体首证实并已开始传播，美国欧洲报告相关病例，需要采取什么措施？ 第1页

媒体不要总想着搞个什么大新闻吓唬人。

这事情大概是从今年1月初的时候就开始有消息，英国《卫报》报道，研究人员早在今年1月便在法国部分地区发现德尔塔克戎毒株。全球共享流感数据倡议组织（GISAID）早前发文指出，法国巴斯德研究院（Pasteur Institute in France）最先发现这个结合德尔塔和奥密克戎毒株的新变种毒株AY.4/BA.1，通称为德尔塔克戎。

当时争议还比较做，nature上还讨论过是不是样本污染造成的。

当然根据现在的情况来看已经公布了测序结果，WHO也认可了这个结果，那就不是样本污染的问题，确实是发现了这种情况。

但这个情况很严重吗？这种德尔塔克戎（Deltacron）是怎么来的？

以前跟大家也科普过，新冠病毒作为一种RNA病毒，与我们传统认知的RNA病毒的高突变不同，它的突变会更稳定一些，经过研究我们认为是一种非结构性蛋白NSP14带来的一种独特的“复制矫正”（proofreading）过程，这一发现还是由我国的饶子和院士团队发现的。

但同时新冠病毒是一种比较容易重组的病毒，什么是重组呢。

举个例子，如果一个人同时同时感染了德尔塔和奥密克戎，假设这两个病毒同时入侵了一个细胞，那么在他们复制扩增的过程中，就会出现重组现象。通俗的解释可以理解为，小明和他的朋友在一起换衣服的时候，穿错了对方的衣服。

但重组的前提是亲缘关系非常近，比如像delta和Omicron这样，你要让新冠病毒和HIV去重组就很难了。打比方就是小明可以跟他的朋友穿错衣服，但不会跟动物园的猩猩弄错衣服。

实际上我们在之前也发现了很多新冠病毒的重组现象，同时也发出过一些预警。比如越南在21年5月就发现了B.1.617毒株和B.1.1.7毒株的重组现象，也就是delta和Alpha的重组。

当时也是各大媒体纷纷报道，引起了一番恐慌，甚至越南卫生部长阮青龙还在发布会上讲这个。

但实际上这种毒株并没有传播起来，为什么呢？

从某种程度上来说，这种两种流行毒株的组合毒株通常都很难传播开，原因在哪里呢？

我们来看看它的结构。

德尔塔克戎毒株与德尔塔毒株基因的遗传背景相同，但有10个仅在奥密克戎毒株中发现的突变。

也就是说，它用的是Delta的骨架，同时具有具有奥密克戎的一些特征突变，尤其是突刺蛋白。

那这是狼来了吗？

如果是的话，为什么没有在大规模的人群中广泛的发现呢？上次越南发现的重组病毒为什么也没有流传开呢？

这其实就是预存免疫的问题。

当人们具备了对Delta和Omicron的抗体的时候，同理对于这种毒株也具备了免疫抗体，不管这种抗体是由疫苗带来的还是真实世界感染的。

比如这个德尔塔克戎用的是奥密克戎的突刺蛋白，那么感染过奥密克戎毒株病产生抗体的人对德尔塔克戎是具备很强的免疫力的。

那么最后一个问题，以后还会发现更多的变种病毒吗？

这几乎是肯定的。只要新冠病毒还在广泛传播，在有这么多“培养皿”里复制扩散，总会出现重组以及突变的情况，未来还会发现新的毒株，有可能是毒性越来越轻，但也不排除出现毒性骤然增加（比如跨物种传播）的情况，我们需要对这些变异进行监控，并保持警惕。

但这些工作都是由专业的人员来完成的，普通人并不用在这方面担忧。

关于这两天在一些媒体和自媒体上大幅报道的Deltacron（德尔塔克戎），还是说几点吧。

先提一下，这个回答会很枯燥。

一

先讲讲一些基础知识。

新冠病毒本身的结构往简单里说，就是核酸加上外面一个蛋白质外壳。而新冠病毒的蛋白质又分为结构蛋白（structure protein）和非结构蛋白（nonstructure protein，缩写就是nsp）两部分（图1）。

结构蛋白就是我们听得比较多的刺突蛋白S、包膜蛋白E、膜蛋白M和核衣壳蛋白N这四种，它们是构成病毒颗粒所必须的蛋白质，而非结构蛋白有十几种，它们是病毒基因组编码的、在病毒复制过程中具有一定功能，但是不结合于病毒颗粒中的蛋白质。

咱们要是把新冠病毒的RNA拍扁了，大概就是图2中这样。很长的一节ORF1a/b基因（天蓝色/粉色），然后较长一节S基因（绿色）。我相信很多人都有做过核酸检测（RT-PCR），核酸检测的最重要靶序列之一就是新冠病毒相对保守的ORF1a/b区域，几个变异体的突变都不影响核酸检测。

二

接下来，咱们再说说新冠病毒的突变/ 基因重组是怎么回事。以下这部分我在去年八月份的时候有说过，直接照抄过来。

咱们用流感病毒举例说明。

流感病毒的突变是过去研究得比较多的。和新冠所属的冠状病毒不同，流感病毒会通过抗原漂移（antigenic drift）和抗原转换（antigenic shift）的方式发生改变。

流感病毒的基因组由8个独立的RNA片段组成。简单来说，抗原漂移是流感病毒在复制过程中，随机出现的复制错误（点突变）逐渐累积起来，导致表面抗原改变；而抗原转换是两种不同类型的流感病毒在同时感染一个个体时，基因组出现交换和重配（reassortment）引起的巨大变化。

抗原漂移是流感病毒基因的微小变化，导致病毒表面蛋白的血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）的改变（你听过的什么H1N1、H7N9，指的就是这俩糖蛋白的不同）。当抗原漂移不断累积，我们的免疫系统可能无法识别抗原并预防新的流感病毒造成的疾病。

而抗原转换的概率比抗原漂移低很多。它是甲型流感病毒发生巨大变化，由两种（或多种）不同的甲流病毒株重配产生全新的病毒株。而大多数人对抗原转换产生的新病毒没有抵抗力，这有可能会导致流感大流行，比如2009年的H1N1，这个毒株是四种不同毒株（人类、禽类、北美猪和欧亚猪）重配产生的产物。

甲型流感病毒会发生抗原漂移和转换，也是唯一一种会引起大流行的流感病毒，而乙型流感病毒只会发生抗原漂移。简而言之，流感病毒的这两个机制，是为什么我们每年要更新流感疫苗以及流感可能出现大流行的主要原因。在过去的一个多世纪里，甲流在全球一共出现四次全球大流行。

就像上面所说，新冠病毒所属的冠状病毒，其突变速度低于大多数其他RNA病毒，尤其是甲流病毒。而冠状病毒的基因组不像流感病毒有分段，它是单一一段很长的RNA组成，当两种冠状病毒同时感染时，它们可能会发生重组（recombination）而不是重配，但也可能产生新的病毒——比如新冠病毒。

三

所以新冠病毒不同变异体之间的重组是存在的，重要的是找出证据证明这一点，并且分析重组后的毒株特性。

（关于Omicron和Delta的重组，很多人会提到一月份塞浦路斯的研究，实际上那个研究很可能是实验室污染出现的问题 （污染导致的PCR重组），根据在nextstrain上传的样本测序结果，24例Delta都没有单系来源。）

我们回到这次的研究，先说一点，「Deltacron」并不是一个正式的命名，在研究中也没有用这个名字。这项研究发表在medrxiv上，标题是「Evidence for SARS-CoV-2 Delta and Omicron co-infections and recombination」。从标题中我们可以知道研究人员发现了两点，第一是这两种变异体的共感染（co-infections），第二是它们之间的重组。

研究人员对2.9万个感染病例的样本进行了测序，最终发现了20例共感染，并且有2例出现了Delta和Omicron的重组。

那么关键问题是，如何确认是重组？我们看看最关键的证据，这是研究论文中的Figure 3（图5）。

从5`端到3`端，可以发现在ORF1A区域，Delta的替代等位基因部分频率维持在0.8左右，但是从S蛋白的S214开始，突然降为0.5，一直到3`端。

这表明在S:214EPEins之前有一个断点（图上用灰色柱子标识），这个地方出现了Delta和Omicron的重组。

而在这两个重组样本中，它们的断点略有不同，重组样本1（recomb1）的断点在S:G339D附近，重组样本2则在S:T19R附近（图6）。

人们最关心的应该是，Deltacron的传染性、毒性以及对疫苗药物的影响如何？目前的重组病毒还是非常有限的，但是我们可以发现一点，它们的S蛋白主要是来自于Omicron，而S蛋白是新冠病毒与人体细胞的结合位点，也是疫苗的靶点，也就是说，Deltacron的疫苗抵抗特性，可能更接近于Omicron。

这个变异体是需要监控的，但是这项研究的第一作者Alexandre Bolze也表示，目前只检测到2个Deltacron（在2.9万个样本中），表明它在与Omicron的竞争中似乎没有优势。我们可以回想一下，真正有竞争力的变异体（比如Delta和Omicron）当时成为主流变异体有多迅速，而按照Deltacron的上升速度，它不太可能在全球范围内产生重大影响。

最后，我们总结一下，新冠病毒的重组本身是意料之中的事情，这次的Deltacron是值得监测的变异体，在将来也会有更多的研究出来，但是目前大家并不需要为之恐慌。