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量子力学适用于 DNA 尺度的分子吗? 第1页

  

user avatar   mandelbrot-11 网友的相关建议: 
      

适合。目前,在DNA研究方向,量子力学主要应用在解释DNA的点突变。

DNA分子是大量碱基对连接的双螺旋结构。你也可以把它想象成一个螺旋状的梯子,而每一级阶梯就是两个匹配的碱基构成的碱基对。

DNA的变异有很多种,比如一段DNA被复制,删除或者替换等等。其中最简单的就是点突变(point mutation,也就是单个碱基对的突变。点突变其实也有若干类型。如果我们凑近点看,往往会发现,推动这些变异的都是各种如幽灵般扑朔迷离的量子效应。

下面来看两个例子吧。

1. 漂移的电子空穴——弥散的概率云

当高频电磁波(如X射线)照射到一个碱基上,光子携带的能量足以把一个电子从这个碱基上轰走。这样,原来这个电子的位置就产生了一个电子空穴。由于那个被迫流离失所的电子是带负电的,所以你可以把这样一个空穴看成是一个带正电的粒子。

电子空学穴可以在不同的原子甚至碱基之间游走,形成电流。这种电子空洞可以对碱基造成伤害。比如,带有空穴的鸟嘌呤可以和水发生化学反应,改变自己的结构,从而引发DNA变异。这样的变异多数是有害的。

根据这种经典物理理论,电子空穴是局域性的——它只能作用于它当前存在的单个碱基。然而,实验结果却总是和这种理论预测有出入。毫无疑问,这个理论并不准确。

这时候,量子力学带着新的解释闪亮登场了:电子空穴和电子(以及其他微观粒子)一样,并没有一个确定的位置,而是同时以不同概率出现在不同的位置,也就是说,它会弥散成一朵概率云。云的中心,空穴出现的概率最大;距离云的中心越远,空穴出现的概率越小。

根据这个理论,一个电子空穴覆盖的范围就大大扩展了。一个空穴可以同时对至少4个碱基产生影响。而实验结果完美地验证了这一预测。

2. 跳跃的质子——量子隧穿

四种碱基都有自己特殊的形状,所以一种都只能和特定的碱基构成碱基对:腺嘌呤-胸腺嘧啶,胞嘧啶-鸟嘌呤。从下图的腺嘌呤-胸腺嘧啶碱基对可以看出,氢原子和同一个碱基中的其他原子是由共价键连接的,而碱基之间是由氢键连接起来的(图中的虚线)。

相对来说,氢原子和其他原子之间的共价键(比如上图中的N-H)比较弱,在某些极端的情况下会断开,从而让氢原子被氢键另一头的原子夺走,变成另一个碱基的成员。当这种质子(即氢原子核)叛逃敌营的情形出现的时候,碱基对中的两个碱基都会发生变异。

看起来质子跳跃似乎不难,但是实际上并不容易。在DNA复制过程中,平均10000到100000次碱基对中,才可能出现一次质子跳跃。而且变异的碱基对很不稳定,在50到200微秒之内,那个叛逃的质子就会因为思家心切,启程回家,让这个碱基对回复原状。

上图是一个质子跳跃变异的例子。通常鸟嘌呤(G) 和胸腺嘧啶(T)是无法构成碱基对的,因为它们都有一个突出的氢原子,导致两个碱基相互排斥。然而,如果胸腺嘧啶中那个氢原子跳跃到鸟嘌呤中的氧原子身边,问题就解决了。这样,两个本来不相容的碱基就可以共享它们短暂的甜蜜时光了。

然而,生物学和经典物理理论都无法解释,质子跳跃是怎么发生的。质子跳跃需要跨越强大的势垒,而质子本身的能量是远远不够的。质子是从哪里获得的能量来完成这个惊世一跃呢?部分物理学家相信,是量子隧穿在背后悄悄推动这一奇迹。在极小的概率下,粒子可以悄无声息地穿越势垒,不消耗一点能量。尽管量子隧穿发生的概率很小,但是在存在大量氢原子和氢键的DNA中,这个概率就不能忽视了。

这个理论并没有完全得到证实。物理学家为之设计了各种实验。比如一个实验是这样的:在重水中培养的细菌只含有氢的同位素氘,它的原子核不仅有一个质子,还有一个中子,所以氘原子核的质量大约是氕原子核质量的两倍。这样沉重的粒子,要完成隧穿的难度要大得多。可以推断的是,重水细菌发生变异的概率也比普通细菌要低。

实验结果表明,量子隧穿对质子跳跃的推动作用似乎是成立的,但是还不足以证实。我们只能等待将来的实验能给出肯定的答复了。

其实,除了遗传学,量子力学在生物学领域还有很多其他的应用,这里就不一一赘述了。


user avatar   jiehou1993 网友的相关建议: 
      

除了 @Mandelbrot 提到的隧穿效应,DNA中的氢原子还有另一个很明显的量子效应,也就是零点能(Zero Point Energy)。

原子的运动实质上就是温度的微观体现。从能量均分定律可知,原子的平均动能应该和温度成正比。

按理说,在绝对零度下,所有的原子都应该是固定不动的,动能严格为零。

可实际上,由于不确定性原理的存在,束缚态下物质的动量不能是精确值,基态的动能并不为零。

低温下被化学键束缚住的原子都在能量最低点附近做微小振动,因此可以近似的当初简谐振动处理。

谐振子的薛定谔方程还是很好解的,一维谐振子的基态能级 。

对于同样强度的化学键, 随振子质量的降低而升高,零点能也就随之升高。

因此,氢作为质量最轻的元素,其零点振动效应也就最明显。零点能可达到0.3 eV左右,已经能和一些弱的化学键键能相提并论了。

所以啊,我在这里以一个(被审稿人用零点能怼过很多次的)长者的身份提醒你们,如果不考虑氢元素的量子效应,论文上对DNA能量的报道出现了偏差,你们可是要负责的。




  

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