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美媒报道「奥密克戎或源自老鼠」，有哪些科学依据？真实性如何？第1页

paizhaorushi 网友的相关建议:

谢老铁邀。

这个起源问题，我在公众号那边已经写得比较详细了。

免疫缺陷病例长期感染养蛊的假说见这里：

动物（特别是啮齿动物类）回传的假说见这里：

另外咱还搬运了一篇Kai老师发表在《Science》的综述，

里面也提到了题主问题描述所说KG Anderson老师的观点，可以见这里：

总结总结就是：

Omicron的起源几乎不可能靠着回溯实锤；
但绝逼不是德班某病毒实验室泄露出来的；
主流意见分为三派：免疫缺陷病例长期感染假说、动物回传假说和长期隐匿流行假说；
注意以上三种假说并不互斥；
免疫缺陷病例长期感染假说的主要依据是几个眼熟的突变位点：刺突蛋白69/70DEL、144DEL、N440、G496、D796、核衣壳蛋白P13L、ORF1a:3675DEL等；
免疫缺陷病例长期感染假说的另一个依据是ins214EPE插入突变，插入片段的来源是灵长类动物的TMEM245，而整个南部非洲唯一有可能对人类造成新冠病毒传播的灵长类动物就是人类；
另外我们也初步观察到免疫缺陷病例身上的变异株相对屁民毒株出现NTD结构域插入突变的风险更大；
动物回传假说的主要依据则是另外几个眼熟的突变位点：刺突蛋白K417、G446、Q493、Q498、N501、Y505、H655等；
需要注意，动物回传假说涉及的那几个突变，发生频率比免疫缺陷病例长期感染假说涉及的那几个突变要低得多。

具体发生频率可以参考这个表（截止2021年10月30日）：

所以情况就是这么一个情况，

要说科学依据，

其实两种假说都各有一些间接依据，

但又都不够实锤，

估计以后也不可能实锤。

哦对了，再补充一下第三种假说（长期隐匿流行）的依据吧：

已经找到了疑似和Omicron有共同祖先的测序记录，推定演化树分支发生在2020年5月左右，现在一共两份测序记录，分别于2021年7月底和10月中旬在南非豪登省和西北省检出；
已经找到了高度疑似和Omicron有近期（最近？）共同祖先的测序记录，推定演化树分支发生在2021年中，现在一共8份测序记录，分别于南非、土澳、加拿大和新西兰检出（其中新西兰的疑似是南非输入病例）。因为这个表亲辈的存在，Omicron的命名将发生调整，由B.1.1.529变为BA.1，而表亲辈则命名为BA.2；
以前也发生过隐匿流行憋出阴间变异株的例子，比如A.30（在坦桑尼亚隐匿流行，在安哥拉/瑞典/英国检出）和B.1.640（在刚果隐匿流行，在法国检出）。

——请品鉴：

↑ 上面是截止昨天的Omicron演化树（unrooted tree），