1952年的时候大连舰艇学院是第一海军学校,海军工程大学是第二海军学校,都是渊源很深的老牌军校。
海工在数十年发展史上合并/联组了很多学校,比如海军第六预备学校(1957)、海军炮兵学校(1957,部分)、海军海道测量训练大队(1957)、海军通信学校(1970,部分)、海军军械学校(1970,部分)、海军电子工程学院(1999)、海军后勤学院(2004)等等。相比之下大连舰艇合并的学校很少,规模更小,所以现在仍然是学院而非大学。
综合实力上现在肯定是海军工程大学强一些了,因为海工已经是综合性军校,有34个本科专业,而且很多专业并不是海军导向的。相比之下大连舰艇只有7个本科专业,而且都是海军导向的,窄一些。过去大连舰艇不在军队2110工程里所以比较吃亏,现在已经加进去了。
看你的导向吧,要是决定在水面舰艇上就职那就选大连舰艇学院,如果只是想上军校的话海军工程大学更合适些。