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为什么「分子 CT 扫描技术」能入选 Science 2018 年度十大突破? 第1页

  

user avatar   wei-jun-nian 网友的相关建议: 
      

这是一个非常激动人心的工作,将极大的改变有机化学领域,我甚至认为,赢得一个诺奖也不是不可能

//我一直等着谁来跟我科普,结果等了半天,国内资讯都是照搬英文媒体报导,还尼玛是机翻……作为一个常年用单晶测定结构的人,我尝试抛砖引玉吧。

//我似乎炸出内行了,非常感谢!但是麻烦您们批评我之余可以多指导两句,我是真想学习了解,你不搞有机不知道我们对于结构的执念有多深…

这是一个真正革命意义上的工作,将深刻改变化学家对结构鉴定的理解。

化学就是研究物质的组成、结构和性质的科学。时至今日,只要样品能到实验室,研究组成没什么难度。(样品到不了手,比如宇宙中的物质组成,那是另一个课题了)

结构的鉴定,一直到今天,仍然不能说容易。细数结构鉴定的发展史,就是诺贝尔奖的颁奖典礼,质谱,核磁,X射线衍射,拉曼光谱,电子显微镜,中子衍射,等等等等,而且不仅初次发现拿奖,改进了还能再拿奖!

不做化学科研的人,看着我们每天画着结构式特别酷,但是做化学,尤其是有机化学的我们,非常清楚,每一个新合成化合物的结构鉴定并不容易

一般的做法是质谱确定分子量,元素分析确定组成,核磁定结构。

也就是说,这个结构式是推理出来的

简单的分子问题不大,大一点的分子,比如复杂的天然产物和药物中间体,这个推理过程就很要命了!哪怕是享誉盛名的大科学家,也推错过!

详细不深入展开。怎么解决?一个理想的解决方案就是直接看。也就是用X射线单晶衍射技术这个相机。这是唯一的直接看的工具

不深入展开X射线单晶衍射,毕竟是得了诺奖的技术,很成熟了。无数结构的鉴定就是靠这个,尤其是我们做金属有机化学的,一直笑称“无单晶,无结构”,只有眼见才为实。

培养一个单晶的难度是非常大的,具体可参见我之前的一个自嘲的回答。极端点,我们有时候戏谑道:

zhihu.com/question/6227

“一个单晶结构就是一篇SCI文章!““养单晶是艺术,是炼晶术,不是科学。”

这其实极大限制了有机化学和金属有机化学的发展。

好了,到了这个“分子CT扫描技术”了。Tamir Gonen是冷冻电镜技术(CryoEM)的专家,一直致力于用冷冻电镜解析蛋白质分子,这个和施一公老师,颜宁老师的工作有相通之处。

为什么要用CryoEM研究蛋白质?因为你几乎不可能养出一个完美的蛋白质晶体,来用于X射线单晶衍射测定。CryoEM需要的样品相比于X射线单晶衍射要少得多,制备难度也相对更低。

大约到了2018年,CryoEM的分辨率从最初的7埃米到了现在的不到3埃米,为结构生物学立下了汗马功劳。Tamir Gonen更是开发了一个工具包MicroED,在非常理想的情况下,分辨率甚至可以最低到1.4埃米!这次这个突破性工作,用的也是这个MicroED工具包。

//普及一个常识,一根化学键的长度大概也就是1-2埃米

X射线单晶衍射号称分子照相机,理想情况下分辨率是多少呢?使用铜靶,可以到0.77埃米,基本上分子长什么样子,可以看得清清楚楚了!

比如下图就是我自己的文章中的单晶结构,说实话,如果不是有单晶衍射,靠核磁你不太可能推出来……


前面提到,CryoEM用于解析蛋白质,分辨率3埃米左右,那么似乎是不太容易运用到有机分子的(要求分辨率0.9埃米左右)。这里就体现出这个分子CT技术的厉害了!

他们的分辨率接近1埃米!

看看他们的流程,直接拿化合物粉末,制备电镜样品,仅仅需要X射线单晶样品的十亿分之一用量!3分钟收集数据,10分钟解析出结果!


请注意最后一个化合物,如此复杂的分子也可以完美解析!而这种分子的结晶难度(满足X射线单晶衍射级别),谁做谁知道,几乎不可能搞定!

最后他们还无比风骚地测定了混合物的结果!即便是把样品混合在一起,制备后扫描,也可以清晰地显示每个分子的结构!

他们用的CryoEm,一台价格200万美元,看上去很贵,但是真的值!我只想问一句,国内哪家还有空闲的,我要去投奔刷文章……




  

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