确诊难可能卡脖子的因素:
1、试剂盒不够,根据相关报道应该已经缓解。
2、人手不够(可能依然存在)
3、仪器不够,主要是核酸提取设备和定量PCR仪(新建实验室可缓解)
4、P2及以上安全等级检测场所不够(新建实验室可缓解)感谢 @蒙塔基的钢蛋 指正,P2实验室即可检测。
5、检测质量问题,其中危害最大的是假阴性。就是有病测不出来,放走会传染。可能原因主要有:1)采样不当(暂时无法彻底避免)。2)试剂盒设计仓促,功能不稳定(暂时无法排除或解决)。3)工作通量过高,人员疲劳,诸如逆转录等反应步骤的操作质量可能波动(无法避免)
综上,新建实验室至少可以解决设备和场地瓶颈。缺乏能够在P2实验室熟练、长时间工作的专业人员可能成为比较突出的矛盾。
如果新建实验室以后设备、场地还不够,我认为非常时期可以考虑适当降低核酸检测标准,把定量PCR放宽到定性PCR,腾出负压空间直接放离心机、核酸提取仪、常规PCR、荧光读取设备。还用qPCR试剂盒,以常规PCR仪跑40个循环以后定性读荧光型号(有/无)。信号弱或结果与影像学矛盾的再寻求qPCR复测。阳性且和影像学一致的可以确诊。(与目前卫健委规范不符,仅设想)
上述设想是考虑到定性PCR操作训练简单,不需要qPCR的软件使用和数据判读技能,可以快速培训新手操作,少部分专业人员专心提核酸即可。另外定量PCR仪比较少,常规PCR仪器现有数量庞大。而且定性实验对上样质量要求稍宽松,不追求极高扩增效率,给摸索对咽拭子检材“粗处理即用”(在不大幅牺牲灵敏度的前提下,简化现有核酸提取流程)的方法创造条件。
缺点是会放弃样本中核酸的定量指标和PCR扩增的质量检查指标(融解曲线),可能需要配合影像学才能做为依据。
最后,听说核酸提取是限速步骤,如果属实,希望各大生技公司连人带仪器支援自动核酸提取系统。
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火眼实验室据说用的是高通量测序,希望能比PCR更高效缓解当前局面。