高中生物，自由交配的两种方法为什么结果不一样? 第1页
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你注意到的现象叫做连锁不平衡（linkage disequilibrium）
连锁不平衡是指在某一群体中，不同座位上某两个基因同时遗传的频率明显高于预期的随机频率的现象。
在这个例子中，A和B的等位基因频率都是0.6，但它们的组合并不是随机的。A有2/3的几率和B组合，而a和B组合的概率只有1/2。所以不能用第一种方法计算。
在一个理想群体（见下）中，经过一代自由交配后，分别位于两条染色体上的基因座将立刻实现平衡。同一染色体上的基因座则需要很多代基因重组。
Hardy–Weinberg平衡定律：在一个无限大的、随机婚配、没有突变、没有选择、没有迁移、没有遗传漂变的群体内，一个位点上的基因型频率和基因频率将代代保持不变，处于遗传平衡状态。
你可以用配子法计算任何群体，但只有已经实现遗传平衡的群体才能用自由组合法。
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