谢老铁邀。
卫报和ABC又后知后觉了……
我这边已经在12月6日抢跑了,
不好意思又比主媒早了两天,
比昆士兰卫生署早了一天~
——请品鉴:
简单来说,昆士兰这个Omicron分支已经被命名为BA.2,
相对地,其他的Omicron被命名为BA.1。
之前的Pango编号B.1.1.529已经停用。
BA.1和BA.2在的突变列表区别如下:
↑ 如上图,
所以可以看出,
ANU的Peter Collignon老师又在谎报平安了……
这尼玛也叫“基因片段稍有区别”?
BA.2的63个突变里面有27个是特征突变,
这明明应该叫做“基因片段连亲妈都不认识”好吧~
下面咱来撸一撸演化树。
——请品鉴:
↑ 上图是Omicron的(无根)演化树,其中:
主干上的蓝色小圆点都是BA.1;
问题就在于,
2021年7月底检出的那个疑似和Omicron有共同祖先的神秘毒株(演化树上的黄色小圆点),
其实已然突变得很厉害了,
或者说全身上下都是阴间突变也不为过。
——请品鉴:
只看刺突蛋白数量的话,足足有21个:
T95I+G142L+V143N+Y144N+N210DEL+L212I+R346K+N440K+N450D+T478K+E484R+N501Y+D614G+P621S+H655Y+I670M+E748Q+S839H+N856K+T859N+T1027I
甩了Delta八条街。
所以我们可以合理假设,
这玩意儿和Omicron的共同祖先,
可能已经经历过一轮偶发快速突变了
或者用人话来说,
就是已经踩中过武林奇遇,
或者已经完成超级赛亚人一段变身了。
而我们已经知道,
BA.1和BA.2的突变列表又甩了上面这奇葩玩意儿十八条街……
所以很有可能,
BA.1和BA.2(或者它们的共同祖先)都是第二轮偶发快速突变的产物。
或者继续用人话来说,
就是BA.1和BA.2(或者它们的共同祖先)已经踩到了第二坨武林奇遇,
已经完成超级赛亚人第二段变身。
所以之前Emma老师接受《Science》采访时的那个说法可能是错的[1]……
——请品鉴:
Omicron并没有从2020年中就开始暗搓搓地躲在平行世界里憋大招,
而是至少冒了两次头。
我们之前没有发现,
只能怪我们监控得还不够严密~
至于说BA.2没有S:69/70DEL,
没法用赛默飞的试剂盒检出SGTF,
这个没啥大不了的。
以色列中央病毒实验室的Shay老师他们,
已经搞出来可以特异性检出Omicron的PCR产品了,
——请品鉴[2]:
——引物设计如下:
这玩意儿同时针对S:210DEL, N:29/31DEL,以及ORF1a:3675/3677DEL三处缺失突变。
可以说是万无一失了。
但是……
说句丧气话吧,
靠PCR检测快速揪出Omicron这种走捷径行为,
可能并没有什么卵用。
因为根据多个不同模型预测,
最迟到12月底(很有可能更早),
Omicron就会成为全球主流毒株。
到时候随便碰到一个阳性的都大概率是Omicron……
——比如说,请品鉴:
从现在到月底只有不到20天了,
中间还要放圣诞大假
从头开始生产新试剂盒也来不及了,
还不如两眼一闭,两腿一分,
躺平了吧~
(至于说国内咋办?
国内反正都是100%测序,
完全没影响)
所谓“难被 PCR 识别”,并不是核酸检测不出来的意思,而是没有omicron标志性的SGTF,无法快速识别是不是omicron的意思。
貌似现在西方有一种声音,“要与delta共存,但要防控omicron”,这种论调,无疑是荒谬而没有实际操作性的。唯一的结局是转进“与omicron共存”。毕竟21世纪是生物的世纪,病毒传播的自由是21世纪最高的自由。
拜登已经在吹风了。
辉瑞说的很有言语的艺术,“三针辉瑞疫苗对omicron的效果,与两针辉瑞对delta的效果相当”,然后开动宣传机器就行了。至于“两针辉瑞对delta的效果”具体是多少,或者穿透一下这个问题——有多少美利坚耗材会死了或者后遗症,显然拜登和他的团队是不care的,反正是耗材。
核酸检测测不出来,就意味着疫情结束。
至于还是会有很多老弱病残因为不明原因的咳嗽发烧挂掉,那不是正常现象吗?比如14亿人口大国印度每年死亡一千万人,因为不明原因再多增加死亡一百万老弱病残,也不令人大惊小怪。
新冠在人类历史上的瘟疫中根本排不上号,这两年造成这么大影响完全是人类自己娇气给作的,当然核酸检测技术的普及是其中必备的条件。
首先,这个题问的就有问题。
Omicron的新发现的变种,也就是BA.2,这个毒株不是不能被PCR检测到,目前所有的新冠变异毒株都能被PCR核酸检测发现。
现在发现的问题是,想通过PCR快速的区分毒株类型,说实在的这是一个取巧的方式,我们以前并不经常用这种方式。
比如我们平时看报道,都是某地发现了感染者,隔了2天左右,报道会说,经过基因检测,感染的毒株是Delta如何如何。这些都是经过了测序才确认的毒株的分型,PCR是做不到的。
那么为什么说BA.2这个毒株难以被PCR检测分型呢?是因为我们发现的最初版的Omicron毒株,也可以叫BA.1,他有一个S蛋白的69/70的氨基酸缺失突变,而这个刚好可以跟一些检测S蛋白的PCR试剂盒碰上了,也就是说这种特殊的试剂盒可以在检测是否阳性的同时,还能反馈一个是否有69/70的突变,来判断患者是否为Omicron毒株,但这玩意准吗?肯定不准啊,这个要是准了,还测序干啥。
为什么这么说?因为本身这个检测69/70的试剂盒,是以前开发出来检测Alpha毒株的。也就是说,你即便在这个试剂盒里反馈了阳性结果以及69/70的缺失,但你还是不确定这个是Omicron还是Alpha。
我们国内也开发过Delta专用的试剂盒,但为啥大家很少听说呢?因为从Delta大爆发以后,我们遇到的所有输入病例,几乎全是Delta毒株,就突然间没有用武之地了。
所以这并不是什么问题,即便发现了BA.2的这个情况,也只是把以前想图省事的一个方式堵死了而已,如果真的想专门检测BA.2,那依然可以开发专门匹配的试剂盒。但意义有多大呢?
我不理解的是,为什么Delta西方就觉得可以放过,可以躺平,Omicron就要严防死守。你这搞病毒种族歧视呢?瞧不起谁呢?
要么就一起躺平,要不就动态清零,试图人工筛选流行毒株?达尔文棺材板都压不住了好吗?