同时也感谢 @去宥 的邀请。
关于新冠病毒新突变体可能逃避细胞免疫这事吧,怎么说呢,意料之中?或者说我有一种早晚都有这么一天的直觉。
我们知道病毒是容易在复制中出错的,而外界的环境会对它的复制有一定的影响,比如常提起的免疫压力。就是说康复者血清和接种疫苗的人产生的抗体会对病毒产生一个突变压力,会把没有逃脱这2个压力的病毒都是杀死,只有逃出去的才有传播的机会,比如我总说的E484K突变,也就是B.1.351和P.1这两个突变毒株都拥有逃脱或者部分逃脱康复者血清和接种疫苗的人产生的抗体的能力。
但上边说的免疫属于体液免疫。而人体还有一个重要的免疫机制是细胞免疫,像T细胞这种,而新冠病毒能否在T细胞的压力下产生逃脱进化,按着以前我的想法是肯定没戏的,这个难度系数太高。但是按着现在全球病毒突变的情况,真的是凡事都有可能啊,下边这篇论文就说的这个事情。
在清明节那天,日本多家研究机构联合发表了一篇关于新冠病毒逃脱细胞免疫的论文在生物学预印本网站bioRxiv上。
论文巨长有50多页,我就简单的把highlight列出来让大家先看看,如果后边有其他的需要让大家了解的东西就在更新吧,或者大家有啥关注的我也会更新。
L452R (in B.1.427/429) and Y453F (in B.1.298) variants in S RBM have emerged
L452R and Y453F mutants escape from HLA-24-restricted cellular immunity
L452R increases viral infectivity and potentially promotes viral replication
Epidemic of L452R-harboring B.1.427/429 variants has been expanding in USA
这是论文作者自己的highlight,估计他们也感觉到论文太长了,直接给标记出来了。
这里边说了4个事情。
这两个突变是,L452R(B.1.427 / 429)和Y453F(B.1.298)。关于RBM多解释一句,以前我们关心的都是新冠病毒的S蛋白的RBD(受体结合域),RBM可能关注的少点,RBM是受体结合基序,是RBD包含一个环部位。大概捋一下应该是。新冠病毒>S蛋白>S1表面亚基和>RBD>RBM,这里边应该是一个包含关系,我打不出哪个包含符号来着。所以RBM可以理解为是新冠病与与ACE2结合的核心中的核心,它有多关键呢?很多它是病毒中和抗体的主要靶标,它发生的一些突变,甚至可以改变病毒从动物到人或人与人之间的传染性。
这里可能简答的理解还好,但是要详细的解释就非常复杂。
简单的理解就是新冠病毒的这2个突变会诱发病毒逃脱了细胞免疫的限制。
复杂解释起来就麻烦了,我尽量用大家能理解的语言解释一下。
比如文章中提到的是HLA-24,我感觉应该是HLA-A24,少打了个A。
那么得先解释什么是HLA,估计遇到过白血病病人骨髓配型的听过这个词。
人类白细胞抗原(英语:human leukocyte antigen,缩写为HLA),是编码人类的主要组织相容性复合体(MHC)的基因。
这个基因与人体的非常多的免疫反应相关,比如做骨髓移植的时候,需要进行HLA-A、HLA-B和HLA-DR三个位点的匹配,如果不匹配就没法移植。强行移植的话会被患者的免疫系统攻击到死。
那么HLA-A又是啥呢?这是一个MHC分子,它的作用也挺多的,举个例子。
比如一个细胞被病毒感染了,那么HLA-A分子会将这些病毒的碎片(一个小肽段)转移到细胞的表面,然后来吸引杀手T细胞(就是我们说的CD 8+T细胞)过来杀死细胞。你们大概可以理解为,向我开炮的感觉。
然后接着往下绕。
研究人员认为,新冠病毒中的RBM中的一个被称为“ NF9”的肽段,可能是HLA-A24呈现的潜在表位。啥意思呢,就是HLA-A24分子,会把这段肽段当成信号物举到细胞膜外边来吸引杀手T细胞来干活。他们还进行了验证,经过验证,NF9肽是一种免疫显性HLA-A24的限制性抗原决定簇,会被COVID-19恢复期的CD8 + T细胞识别。
具体验证方法看下图(过于专业能看就看,看不懂就跳,没关系)
(A and B) Detection of the HLA-A24-restricted NF9-specific CTLs. The HLA-A*24:02-positive CTL lines of 3 seronegative donors and 9 COVID-19 convalescents were stimulated with or without 1 μM NF9 peptide (NYNYLYRLF, residues 448-456 of the SARS-CoV-2 S protein). Representative FACS plots showing the surface expression of CD25 and CD137 in the CD8+ T cell subset (i.e., CD3+CD8+ cells) of a seronegative donor (left) and a COVID-19 convalescent donor #1 (right) (A) and the median of the percentage of CD25+CD137+ cells in CD8+ T cells (B) are shown. In B, the COVID-19 convalescent samples >3 SD of the median of NF9-stimulated seronegative samples are indicated with red asterisks.
而我们前边提了,L452R和Y453F这两个突变刚好是RBM上的突变,也就是说这两个地方突变了以后会导致NF9发生变化,从而让新冠病毒逃脱了T细胞的攻击。
看到这条的时候我觉得相比前边的发现都不算啥了,大概可以理解为L452R这个突变会增加病毒与ACE2的结合能力,变相增加了病毒的传播能力,这跟D614G哪个是差不多的套路,同时还会增加病毒的自我复制能力,现在类似的功能突变已经很多了,不差这一个。
这是说啥呢,就是说最早的Y435F是从丹麦发现的,就是上次被广泛报道的丹麦发现的神奇突变,能感染人还能感染水貂,甚至还感染了丹麦大批的猫。但是后来这个突变没活下去,在丹麦逐渐在减少消失。
另外的L452R突变,最早也是在丹麦发现的类似突变,但在丹麦没发展起来,随后在墨西哥的一个州被发现,然后就是在美国加州被发现,随后迅速的上升。
emmm,美国现在真的是收集了各种变异毒株啊。
所以综合这4点,可以概括为,美国现在正在流行着一种,可以逃脱细胞免疫的新冠病毒变种毒株。
事实胜于雄辩。再过一个月点开链接看看就知道了。