钻石公主号乘客开始下船，首日下船约 500 人，对日本的疫情防控会有哪些影响？ 第2页

愧对大家，我删除了通过基因序列进行进化树计算的内容，毕竟没经过同行评议。

本文所有内容均出自已经公开发表的期刊、数据库以及资讯。

个人认为日本的情况不容乐观。

————传播过程中的自然选择————

病毒是RNA病毒，相对容易突变，事实上，根据目前的证据，该病毒已经有许多突变了，下图每一个线条都是l代表了突变，横轴是病毒基因组的位置^[1]

我们可以看到，这个病毒的突变几乎是全基因组上的，而突变被固定下来，那就是进化了。

病毒进化很依赖于自然选择，而这个自然选择，就是人体。

举个浅显的例子。假如病毒的源头是感染了A，那么，对于外地人来说，大概率是

A→B

（当然后期出现了无疫区接触史的，我们认为是发生了B→C）

但是对于疫区来说，由于病毒不断地从一个人传到另一个人，在一个封闭的城市里，那就是不断地传播，所以疫区可能已经是

A→B→C→D→E→F→……

而每一次传播，都是一次自然选择[2]。

传染性毒株的增加首先会导致少量具有繁殖优势的毒株的产生。随后这些带有繁殖优势的克隆会在数量上占据主导，从而获得更多进一步进化的机会。

为何这么讲呢？

打个比方，病毒A进入了人体，然后复制过程发生突变，产生了BCD,如果他只在这个人体上，那么它最终经过了这个人的筛选，可能是这个人体会有ABC这三种类型（假定D不适应人体而没获得进化优势）。

但是当这个病毒继续传播到下一个人时候，又一次自然选择，于是又增强一次，最后就是，线性传播越多，自然选择越多，病毒变异越多。

————钻石公主号的传播猜测————

钻石公主号的，应该不是一个携带者感染了所有的人，而很有可能是A→B→C→D→E→F这种模式，换句话，钻石公主号上的病毒，可能经过了多次自然选择，已经成为了传染性较强的病毒了，这个病毒释放到日本本土，那就是很麻烦的事情了。

—————一些说法—————

病毒的快速进化并不是罕见例子，我这里人微言轻，所以就引用我们进化领域的泰斗吴仲义先生和中科院的蒲慕明院士的一篇文章的话^[2]：

在2002-2003年非典爆发期间，就有研究观测到了这种发生在人群中的传染性的进化，即逐步进化出现了具有超级传染性的毒株。从病毒株的基因组数据中，我们可以收集到这种进化的证据。在SARS病毒中，最具侵略性的菌株在多个关键基因上存在突变，而这些突变需要时间来累积。通常认为在多数病人身上发现的占主导地位的单克隆是逐步形成的，它们最终可能进化成为超级病毒。同样重要的是，那些在进化树上累积了许多突变的样本，但数量上较少的克隆，有可能蓄势待发，在短期内变成优势克隆。

而从卫健委的角度，已经体现出来了对病毒突变的重视：

就是提到了如果基因检测， 不是按照完全匹配，而是高度同源。

事实上，目前更新的数据库显示，病毒株已经有186株了。

改变形式包括错义突变，同义突变，以及编码区突变，且有氨基酸改变^[3]

希望日本的情况不是我猜测的。

山川异域，风月同天。

参考

1. ^nextstrain https://nextstrain.org/
2. ^吴仲义蒲慕明：当病毒进化远快于信息传播，期刊要有所作为 https://tech.sina.com.cn/roll/2020-01-30/doc-iimxyqvy9082036.shtml
3. ^2019新型冠状病毒信息库 https://bigd.big.ac.cn/ncov/

天啊，各国真别骚操作了。传来传去不断变异，别到时候大家一起完蛋。希望这500人无恙，基本能符合14天潜伏期，大家都能心安。不想看到出现大把无症状传播，或者超长待机的潜伏。

我现在觉得全世界沦陷只是时间问题了。。。

估计很有可能新冠病毒会常态化。。。