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意大利 2019 年 12 月口咽拭子中发现新冠病毒,与武汉的病毒序列 100%相同,说明了什么情况? 第1页

  

user avatar   xi-yang-86-73 网友的相关建议: 
      

这是在新冠早期传播问题上的一个巨大进步。

测序结果不同于之前很多研究使用的免疫技术,不但准确程度更高,而且信息量要大得多,可以提供近似关系的信息。

100%的identity说明就是同一个东西,而且时间上间隔极近。这个研究扩大了最早期病毒株在地理上的定位范围,说明新冠在国外的流行引发注意之前就已经存在了,并且说明了武汉和意大利在病毒传播上的紧密联系。

后续什么样的发现可能更有价值?如果能发现更早时间的病毒序列,并且和现有序列不是100% identity,而是存在差异,那么会是更有价值的。

另外:我十天之前就提问了完全相同的问题,完全没有流量。看来知乎现在的确已经是官方推荐和大机构把控流量的时代了,个人用户毫无意义。不知道有什么替代品?


补充:看了一下原文,位于wwwnc.cdc.gov/eid/artic

研究团队测试了39个19年9月到20年1月之间的咽拭子样本,PCR并Sanger测序了S蛋白上面的四百多个bp,其中一个样本为阳性,其它都是阴性。序列ID是MW303957,有兴趣可以去参观比对。

所以这不是全基因组测序,那么它提供的信息量其实是下降了的,不能说是同一个病毒。但这依然说明了这个意大利株和早期国内株之间的亲密关系(何况S蛋白很重要),我前文的论述效力大致不变。

PCR+Sanger测序是实验室里常用的操作套路,用来低成本检验一些先期问题。如果能对阳性样本做高通量测序,获得更全的病毒序列,这个研究的价值还会更高一些。

另外,这个发现依然不能像很多回答期望的那样“洗清武汉污名”或者把锅推到国外,因为仅仅是紧密联系,并不能说明武汉的病毒是意大利传过去的,或者意大利的病毒是武汉传过去的。




  

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