如何看待 Nature 研究揭示 CRISPR 介导的基因编辑造成大范围的 RNA 脱靶突变？ 第1页

标题党害死人啊，昨天晚上票圈里好些人转了这个推文

这个发现不是针对常规的CRISPR/Cas9技术，而是就这两年发现的一种Cas蛋白-gRNA介导的碱基编辑的技术，认为其存在着广泛的脱靶效应。

经典的CRISPR/Cas9技术类似于一段RNA定位到目标位置之后，用一个cas蛋白，像剪刀一样的把目标剪开，再借助同源修复或者别的修复，把这个剪开的接回去，接回去的过程中完成基因编辑。但是最近发现的这个技术，本质上不是把目标序列剪开，他用的Cas蛋白甚至是不具有DNA切割的能力的，而是借助另一种酶直接实现对目标碱基的改变，可以直接把C改成T，或者A改成G，具体机理是这样的：

这个技术同样存在PAM，存在编辑窗口，感兴趣的可以具体去看这篇文献

具体怎么评价，我只能说当时上课讲到这个的时候就觉得不靠谱，但是如果能限制APOBEC1的活性以及空间分布，这个技术也不一定就凉了。总的来说在基因编辑领域，越新的技术出幺蛾子的概率越高，Cas蛋白-gRNA介导碱基编辑技术，如果我没记错的话17年左右才开始出现的，一年多的时间发现脱靶什么的太正常了，不要大惊小怪的。

其实就算不脱靶，同义突变之后的序列的mRNA活性，以及其与一些lncRNA的互作都会受影响，所以临床的大范围的应用早得很呢

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说来惭愧，昨天和同学刚讨论过这新发现，看到TL上出现了这个问题就强答了，其实没好好看完那篇文献 。回答里 @麻瓜 解释的非常清楚，大神收下膝盖hhh

Nature这篇文章分两步，第一步告诉大家目前常用的基因编辑工具CBE（Cytosine Base Editor，胞嘧啶单碱基编辑器）除了修改DNA外，大量修改RNA，造成脱靶；第二步，改造CBE，RNA脱靶降低上千倍，解决了问题。

这里的CBE，指的是拿Cas9的蛋白骨架，融合胞嘧啶脱氨酶APOBEC产生的新酶。sgRNA引导Cas9去特定的基因组位置；APOBEC把DNA上的C变成T。两者融合，可以定点改造基因。

但其实APOBEC原本在人体主要负责把RNA上的C变成U，本身主要是个编辑RNA的酶(少数编辑DNA)。当时为了把它应用到DNA上，挑选了可以编辑DNA的APOBEC，做成目前版本的CBE。CBE的RNA编辑活性究竟有没有完全去除，还是个问题。

Nature这篇文章就是告诉大家，CBE的确会造成RNA脱靶，但这个问题被修复了。

这篇文章通讯作者是Editas联合创始人之一J. Keith Joung。Editas公司就是搞基因编辑的，CBE的RNA脱靶问题，早晚有人会发现，自然得解决问题。这次自己发文章优化了CBE，Editas股价还会大跌，有点意思。话说……股价有涨有跌才能赚钱么（手动微笑）。