这个确实有问题,你应该在9月期满的时候就去入管局,申请回国困难或者其他签证,再考11月的B校,到1月更新签证,这样才是正确的顺序。
现在只能先送交,期望入管局批你的签证。如果被拒签,你只能先回国,然后再国内再次申请留学签证,再到日本。也就是走一遍以前申请留学的程序。